Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox6O70238 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rhox6O70238 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rhox6O70238 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox6O70238 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms