Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf5O70191 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf5O70191 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf5O70191 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms