Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Supt5hO55201 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt5hO55201 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms