Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms