Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms