Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms