Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms