Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms