Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdkO55028 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms