Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms