Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DffaO54786 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DffaO54786 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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DffaO54786 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DffaO54786 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DffaO54786 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DffaO54786 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DffaO54786 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DffaO54786 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DffaO54786 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DffaO54786 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DffaO54786 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DffaO54786 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DffaO54786 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms