Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EdaO54693 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EdaO54693 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
EdaO54693 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EdaO54693 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EdaO54693 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EdaO54693 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EdaO54693 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EdaO54693 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EdaO54693 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EdaO54693 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EdaO54693 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EdaO54693 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EdaO54693 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms