Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms