Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FxnO35943 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FxnO35943 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FxnO35943 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FxnO35943 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms