Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl25O35903 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl25O35903 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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