Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Sp100O35892 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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