Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CaluO35887 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CaluO35887 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CaluO35887 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CaluO35887 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CaluO35887 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CaluO35887 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CaluO35887 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CaluO35887 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CaluO35887 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CaluO35887 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CaluO35887 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CaluO35887 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CaluO35887 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CaluO35887 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms