Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms