Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TnxbO35452 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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TnxbO35452 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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TnxbO35452 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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