Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6bO35451 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf6bO35451 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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