Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt1O35449 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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