Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kpna6O35345 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna6O35345 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms