Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms