Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2O35245 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2O35245 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2O35245 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms