Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pitx3O35160 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms