Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra3O35118 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms