Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap23O09044 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms