Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NumblO08919 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NumblO08919 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NumblO08919 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NumblO08919 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NumblO08919 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NumblO08919 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NumblO08919 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NumblO08919 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NumblO08919 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NumblO08919 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NumblO08919 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NumblO08919 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NumblO08919 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NumblO08919 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms