Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Efna5O08543 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms