Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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