Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8906L7N2A2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8906L7N2A2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms