Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer2J3QPU5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms