Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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