Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms