Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21863J3KMP8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21863J3KMP8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21863J3KMP8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21863J3KMP8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms