Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21897J3KMP5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21897J3KMP5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms