Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pot1bH7BX60 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms