Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pabpc4lG5E8X2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pabpc4lG5E8X2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms