Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp17lcG5E8I7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp17lcG5E8I7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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