Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r67G5E8C1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms