Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip12G5E870 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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