Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933406M09RikG3XA12 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933406M09RikG3XA12 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms