Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcf11G3X9Z4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcf11G3X9Z4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms