Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms