Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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H2-M1F7CXU4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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H2-M1F7CXU4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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H2-M1F7CXU4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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H2-M1F7CXU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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H2-M1F7CXU4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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H2-M1F7CXU4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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