Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D430041D05RikF6ZGR6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
D430041D05RikF6ZGR6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms