Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms