Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1bF6V0H0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms