Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms