Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms